Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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NR6A1Q15406 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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NR6A1Q15406 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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NR6A1Q15406 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NR6A1Q15406 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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NR6A1Q15406 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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NR6A1Q15406 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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NR6A1Q15406 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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NR6A1Q15406 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NR6A1Q15406 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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