Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE3CQ15386 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE3CQ15386 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms