Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDGFRLQ15198 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDGFRLQ15198 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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