Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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GPNMBQ14956 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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GPNMBQ14956 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GPNMBQ14956 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPNMBQ14956 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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