Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GINS1Q14691 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GINS1Q14691 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms