Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCD11Q14690 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms