Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SQLEQ14534 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SQLEQ14534 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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