Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE1CQ14123 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDE1CQ14123 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms