Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPSQ13938 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAPSQ13938 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms