Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTCH1Q13635 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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