Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CUL3Q13618 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL3Q13618 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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