Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PEX6Q13608 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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PEX6Q13608 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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PEX6Q13608 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PEX6Q13608 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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