Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC1Q13547 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms