Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3B2Q13435 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3B2Q13435 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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