Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP3B2Q13367 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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