Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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SEMA3BQ13214 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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SEMA3BQ13214 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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SEMA3BQ13214 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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SEMA3BQ13214 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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SEMA3BQ13214 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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SEMA3BQ13214 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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SEMA3BQ13214 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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SEMA3BQ13214 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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