Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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CALCOCO2Q13137 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALCOCO2Q13137 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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