Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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