Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXD4Q12950 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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FOXD4Q12950 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FOXD4Q12950 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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