Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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FOXC1Q12948 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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FOXC1Q12948 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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FOXC1Q12948 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FOXC1Q12948 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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