Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXF1Q12946 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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