Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB40BQ12829 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB40BQ12829 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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