Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GTF3C1Q12789 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GTF3C1Q12789 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GTF3C1Q12789 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GTF3C1Q12789 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
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GTF3C1Q12789 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GTF3C1Q12789 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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GTF3C1Q12789 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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GTF3C1Q12789 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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GTF3C1Q12789 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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GTF3C1Q12789 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF3C1Q12789 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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