Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CPSF1Q10570 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPSF1Q10570 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
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