Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE4DQ08499 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms