Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LOXL1Q08397 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms