Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms