Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms