Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CREMQ03060 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CREMQ03060 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CREMQ03060 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CREMQ03060 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CREMQ03060 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CREMQ03060 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CREMQ03060 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CREMQ03060 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CREMQ03060 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CREMQ03060 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CREMQ03060 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CREMQ03060 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CREMQ03060 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CREMQ03060 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CREMQ03060 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CREMQ03060 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CREMQ03060 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CREMQ03060 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CREMQ03060 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CREMQ03060 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CREMQ03060 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CREMQ03060 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CREMQ03060 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CREMQ03060 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CREMQ03060 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CREMQ03060 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CREMQ03060 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CREMQ03060 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms