Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DSC2Q02487 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DSC2Q02487 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms