Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APBA1Q02410 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APBA1Q02410 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APBA1Q02410 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APBA1Q02410 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms