Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POU5F1Q01860 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POU5F1Q01860 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms