Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms