Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FAM3AP98173 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FAM3AP98173 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM3AP98173 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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