Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EFNB1P98172 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms