Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUCB2P80303 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms