Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITX1P78337 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITX1P78337 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITX1P78337 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITX1P78337 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PITX1P78337 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX1P78337 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX1P78337 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX1P78337 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX1P78337 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX1P78337 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX1P78337 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX1P78337 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX1P78337 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX1P78337 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX1P78337 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PITX1P78337 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX1P78337 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX1P78337 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX1P78337 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX1P78337 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms