Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
RPS28P62857 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS28P62857 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS28P62857 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms