Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVK-21P61565 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ERVK-21P61565 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms