Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SPCS3P61009 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPCS3P61009 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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