Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAM3BP58499 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3BP58499 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms