Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GJA9P57773 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GJA9P57773 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GJA9P57773 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJA9P57773 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA9P57773 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA9P57773 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA9P57773 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA9P57773 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA9P57773 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA9P57773 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA9P57773 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA9P57773 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA9P57773 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA9P57773 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJA9P57773 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJA9P57773 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms