Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BACE1P56817 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BACE1P56817 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BACE1P56817 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BACE1P56817 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BACE1P56817 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BACE1P56817 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BACE1P56817 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BACE1P56817 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BACE1P56817 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BACE1P56817 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BACE1P56817 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BACE1P56817 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BACE1P56817 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BACE1P56817 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BACE1P56817 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BACE1P56817 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BACE1P56817 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BACE1P56817 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BACE1P56817 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BACE1P56817 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BACE1P56817 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BACE1P56817 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BACE1P56817 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BACE1P56817 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms