Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GFRA1P56159 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GFRA1P56159 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms