Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP11P51784 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP11P51784 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP11P51784 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP11P51784 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP11P51784 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP11P51784 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP11P51784 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP11P51784 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP11P51784 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP11P51784 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP11P51784 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP11P51784 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP11P51784 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP11P51784 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP11P51784 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP11P51784 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP11P51784 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP11P51784 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms