Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNBP48739 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms