Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX2P48431 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX2P48431 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX2P48431 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX2P48431 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX2P48431 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX2P48431 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX2P48431 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX2P48431 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX2P48431 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX2P48431 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX2P48431 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX2P48431 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX2P48431 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOX2P48431 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SOX2P48431 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SOX2P48431 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SOX2P48431 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SOX2P48431 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SOX2P48431 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms