Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TM4SF4P48230 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TM4SF4P48230 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms