Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSN1S1P47710 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSN1S1P47710 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms