Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTR1BP42025 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTR1BP42025 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTR1BP42025 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTR1BP42025 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTR1BP42025 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTR1BP42025 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTR1BP42025 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTR1BP42025 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms